巨野职业中等专业学校开设计算机应用、机电技术应用、农业机械使用与维护、建筑工程、电子商务、学前教育、化工工艺、汽车制造与检修、财会、无人机、航空服务等十一个专业，其中计算机应用、机电技术应用、化工工艺专业是市级教学示范专业，机电技术应用是省级品牌专业。汽车制造与检修专业正在积极申报省级品牌专业。
机电技术应用专业
培养方向：培养机电技术应用的操作人员与机电产品营销人员。
培养模式：1.职教高考升学班；2.“三二连读”培养班（济宁职业技术学院）；3.校校联合办学班——港口班（山东港口工程高级技工学校）；4.校企联合办学班——海尔班（青岛海尔集团）；5.五年制高级技工班——数控加工（数控车工）
计算机应用专业
培养方向：培养从事计算机及相关设备的调试、使用、维护、管理、销售的工作人员。
培养模式：1.职教高考升学班；2.校企合作办学班；3.五年制高级技工班——计算机应用与维修。
建筑工程施工专业
培养方向：本专业培养建筑工程施工的操作与管理人员。
培养模式：1.职教高考升学班；2.三二连读培养班（济宁职业技术学院）。
汽车制造与检测专业
培养方向：培养能够胜任生产、服务、管理一线工作的高素质劳动者和技术技能人才。
培养模式：1.职教高考升学班；2.校企合作办学班；3.五年制高级技工班——汽车装饰与美容。
电子商务专业
培养方向：掌握产品宣传、销售、售后服务一线所需的各种电子商务技能，具有电子商务中职层次的高素质高级技能型专门人才。
培养模式：1.职教高考升学班；2.校企合作办学班；3.五年制高级技工班——计算机应用与维修。
幼儿保育专业
培养方向：本专业培养面向幼儿园及早教机构幼儿园教师及保教人员。
培养模式：1.职教高考升学班；2.就业班。
航空服务专业
培养方向：培养具有扎实的文化基础知识和初步的航空服务英语语言能力和空中乘务、地勤服务等初步专业知识的技能型人才。
培养模式：校校合作办学班——3+3（河北领航航空专修学院）。
会计事务专业
培养方向：培养具有扎实的文化基础知识和理论技能的会计核算人员。
培养模式：职教高考升学班。
增材制造技术应用专业
培养方向：能从事机电一体化产品的生产、测试和数控设备的编程、操作、3D建模、3D打印机现场技术工作等方面的应用型人才。
培养模式：校企合作办学班。
无人机操控与维护专业
培养方向：本专业培养无人机制造、操控，维修维护人员和营销人员。
培养模式：校企合作办学班。
高星级饭店运营与管理专业
培养方向:从事饭店前厅、客房、餐厅、销售等部门的服务运营与管理工作的高素质劳动者和技能型人才。
培养模式：校企合作办学班——（蓝海酒店集团）。
中餐烹饪专业
培养方向：培养从事中式烹调、中式面点操作和营养餐设计等一线工作的高素质劳动者和技能型人才。毕。
培养模式：校企合作办学班——（蓝海酒店集团）。
旅游服务与管理专业
培养方向：培养从事旅游社服务及其他旅游企业服务工作，德智体美全面发展的高素质劳动者和技能型人才。
培养模式：1.职教高考升学班；2.就业班。
康养休闲旅游服务专业
培养方向：培养 能适应康养与休闲旅游产业的结合及其社会化、商业化、产业化的发展，并能组织、策划、开展、指导康养休闲旅游活动等相关工作的实用复合型专门人才。
培养模式：1.职教高考升学班；2就业班。
舞蹈表演专业
培养方向：本专业培养民族传统音乐表演、舞蹈表演、歌舞表演人员，以及为高等院校艺术系科培养后备生源
培养模式：1.职教高考升学班；2.校企合作班——济宁金盛文化传媒。
绿色勘探技术专业
培养方向：本专业培养能够从事铁路、公路、地铁及城市地下空间开发等勘察的高素质劳动者和技能型人才。
培养模式：1.定向就业——倬方岩土公司；2.在岗学历提升，弹性学制专本科。
农机设备应用与维修专业
培养方向：培养能从事农业机械的装配、检测、使用、维护、营销、技术服务、农业机械推广以及设施农业技术应用等工作的高素质劳动者和中等技术技能型人才。
培养模式：1.职教高考升学班；2.就业班。
