学校始终坚持以“以德治校，以德育人”为办学宗旨，以改革创新和科技创新为重点，既注重提高学生的理论知识，又注重提高学生的操作能力。学校不断加大投资力度，每个班级都配备了“标准座椅”，建有6650平方米的实验楼一座，设有电动缝纫机房1个，脚踏缝纫机房2个，家电实验室1个，财会模拟室1个，语音室1个，微机房5个现存机房4个，音乐教室、课件制作1个，电子阅览室1个，电工电子实验室2个，机械加工车间3个，汽修实验实习厂房1个，烹饪、旅游实习酒店、宾馆2处，服装实习工厂1处，美术画室4个，实习基地4处，提高了现代化教学水平，满足了实习教学的需要。
加强师资队伍建设。1999年，学校制订了《关于加强教师进修和培训的意见》，鼓励教师参加各类函授、自考、远程教育。现在，全校教师学历达标率为90%，并有20名教师参加在职教育硕士课程进修班学习。学校定期举行优质课、公开课、示范课评选和教学能手评选等活动，并选派骨干教师参加济宁市教学能手、学科带头人的评选，产生了一大批校内教学骨干和济宁市教学能手，教师的教学水平不断提高，学生升学人数逐年上升，2002年，考入高等院校本、专科学生人数突破200人大关，达历史最高水平。2000～2002年，学校连续3年获得济宁市高考贡献奖，1999～2002年，连续4年获得济宁市对口升专科第1名。
在学生管理工作中，学校以德育教学为首，强化了三个意识。一是法制意识。聘请富有经验的法律专家担任学校法制校长、法制顾问，定期举行法制报告会，提高了学生的法制意识，增强了学法守法的自觉性。二是人文意识。加强了以学生为主体的办学理念，用爱心培养爱心，用智慧启迪智慧，用人格塑造人格。让学生感受到学校的温暖，感受到老师的爱心，提高了学生热爱学校、热爱学习的自觉性。三是氛围意识。学校注重营造良好的校园文化氛围，加强了校办广播站的建设，成立了军乐队、民乐队、舞蹈队、篮球队、书画小组、摄影小组等各种兴趣小组，经常开展活动，丰富了学生的业余生活，在潜移默化中增强了学生的团结协作精神和集体主义观念。
2000年6月20日，曲阜市职业中专举行建校十周年庆典，同日举行国家级重点职业中专挂牌仪式。前来参加双庆仪式的有省教委、济宁市教委领导、曲阜六个班子领导和济宁市各兄弟学校、曲阜各部委办局负责人。校长姚长富作了工作汇报。职业中专被国家教育部公布为首批国家级重点职业中专，填补了济宁市无一所国家级重点学校的空白。
2001年，为实现全市职业教育资源共享，把职业教育做大做强，市委、市政府将原职业中专、技工学校、教师进修学校合并，组建新的曲阜市职业中专，下设时庄、息陬两处分校。合并后的职业中专人员多、摊子大，面临着师资分配、专业设置、课程调整、人员安排等一系列实际问题。当时正值新学期初，为确保教育教学工作的顺利进行，学校领导一班人根据市委、市政府文件精神，科学统筹、合理安排，做了大量细致的工作，将原三校所有人员迅速安排到位，保证了各项工作的正常运行，顺利完成了三校合一的平稳过渡。